LAUSR

Introduction Le mycosis fongoide est la forme la plus frequente de lymphome T cutane primitif. Il se caracterise au stade precoce par des macules et plaques cutanees d’evolution indolente. Une minorite de patients cependant evolue vers un stade avance, generalement refractaire au traitement et de mauvais pronostic. La plupart des donnees de sequencage de l’exome dans les lymphomes T cutanes proviennent de cas de syndrome de Sezary car les cellules tumorales circulantes sont faciles a isoler en grand nombre. Les cellules tumorales dans la peau lesionnelle des patients atteints de mycosis fongoide representent, en moyenne, une cellule sur 100, rendant difficile leur etude. Il y a peu de donnees concernant les alterations genomiques pilotes ( driver ) responsables de la survie et la proliferation des cellules tumorales au cours du mycosis fongoide. Materiel et methodes Nous avons utilise la technique d’ expression microdissection pour extraire les lymphocytes T de la peau lesionnelle de 16 patients atteints de mycosis fongoide. Ces patients presentaient une atteinte cutanee isolee sans clone sanguin circulant identifie par sequencage haut debit du gene TCRB. Treize d’entre eux presentaient un stade I et 3 d’entre eux un stade tumoral IIB. Nous avons sequence l’exome de ces echantillons de lymphocytes T cutanes tumoraux et des 16 echantillons controles d’ADN germinal constitues de cellules mononucleees sanguines peripheriques provenant des memes patients afin de determiner la presence de mutations somatiques, gains et deletions. Resultats Plus de 80 % des cibles etaient couvertes > 20 × chez > 80 % des patients. Les echantillons presentaient une frequence de mutations somatiques relativement elevee avec, en moyenne, 5 mutations somatiques/Mb d’ADN. Le type de transition predominant etait C − > T, evoquant une mutagenese UV-induite. Nous avons identifie des alterations genomiques somatiques recurrentes au niveau de genes impliques dans le controle epigenetique (KMT2 C, KMT2D, ZNF365, ARID1A, ARID3A, NCOR1, TET2), de potentiels genes suppresseurs de tumeur (TP53, CDKN2A, PTEN, NBPF1, RBMX, ZMYND11) et de molecules de surface (HLA-A, PD-1, PD-L1, FAS, CD300E). Certaines de ces alterations n’ont jamais ete rapportees au cours des lymphomes T cutanes. Discussion Treize echantillons supplementaires sont en cours de sequencage. Conclusion Cette etude identifie de potentiels genes pilotes responsables de la tumorigenese au cours du mycosis fongoide, ainsi que de potentiels neoantigenes.