LAUSR

Introduction Le role du virome cutane dans les dermatoses inflammatoires reste mal connu du fait de contraintes techniques specifiques. De plus, sa description reste qualitative car la correlation entre le nombre de reads obtenus apres une amplification random + un sequencage haut-debit (HTS) et le nombre de copies de genome viral n’est pas demontree. Objectif Decrire qualitativement et quantitativement l’evolution topographique et temporelle des papillomavirus et polyomavirus humains cutanes (HPV et HPyV) chez 2 patients souffrant de dermatite atopique (DA) et de psoriasis (Pso). Materiel et methodes Nous avons extrait l’ADN de prelevements cutanes effectues sur peau lesionnelle (PL) et non lesionnelle (PNL) chez ces 2 patients a M0, M1 et M3. A M0, un traitement par methotrexate (MTX) etait instaure chez le patient DA et par dermocorticoides seulement chez la patiente Pso. L’utilisation d’une technique de PCR multiplex AmpliSeq® a precede le HTS. Les resultats etaient compares a une PCR quantitative (qPCR) pour etude de correlation. Discussion Les resultats de l’association AmpliSeq®+ HTS et ceux de la qPCR etaient significativement correles (coefficient κ 0,95), demontrant que l’association AmpliSeq®+ HTS permet la quantification les charges virales, avec cependant davantage de sensibilite que la qPCR. Chez les 2 patients, 31 et 32 souches virales ont ete detectees respectivement, principalement des b et g HPV mais egalement du Polyomavirus de Merkel (MCPyV). La composition de la flore virale etait variable selon la topographie et au fil du temps. Cependant chez le patient DA, les bHPV107 et 120 predominaient en PL (70,95 %), tandis que le gHPV134 predominait en PNL (93,1 %). Chez le patient Pso, le bHPV12 et le MCPyV (65,4 %) predominaient en PL, tandis que le gHPV50 predominait en PNL (92,6 %). Parallelement a l’amelioration clinique, la composition de la flore virale a varie au fil du temps en PL, tandis qu’elle est restee plus stable dans la PNL chez les 2 patients. Chez le patient DA, le bHPV107 n’etait plus surrepresente a M3 en PL (10,3 %) tandis que le gHPV134 continuait de predominer de M0 a M3 en PNL. Chez le patient Pso, en PL, le bHPV12 diminuait a M3 (0,05 %) tandis que le MCPyV devenait predominant (37,7 %). Au contraire, le gHPV50 restait predominant en PNL de M0 a M3. Conclusion Malgre de grandes variations intra et interindividuelles de la flore virale, des signatures virales individuelles qualitatives et quantitatives ont pu etre detectees dans la PNL et dans la PL en fonction de l’evolution de l’activite de la DA et du Pso : la flore virale d’un individu semble peu varier quantitativement et qualitativement en PNL dans le temps, meme sous MTX, contrairement a celle de la PL.