LAUSR

A principal contribuicao da selecao genomica (SG) e a identificacao de animais geneticamente superiores para caracteristicas de dificil mensuracao e/ou avaliadas tardiamente nos animais, tal como o pH da carne suina. Na SG, uma vez que o numero de marcadores e geralmente maior que o numero de animais genotipados, e tais marcadores sao altamente correlacionados (devido ao desequilibrio de ligacao), metodos estatisticos baseados na reducao de dimensionalidade tem sido propostos. Dentre estes, destaca-se o Quadrados Minimos Parciais (PLS) pela simplicidade e alta acuracia de predicao. Porem, a determinacao do numero otimo de componentes a ser utilizado no PLS ainda se caracteriza como um desafio para a aplicacao do metodo. Assim, objetivou-se aplicar o PLS (e tambem regressoes em componentes principais e a multipla tradicional) na SG para pH da carne suina (medido aos 45min e as 24 horas apos o abate), bem como identificar o numero otimo de componentes por meio dos metodos do grau de liberdade (GL) e validacao cruzada (VC). O primeiro e baseado na Teoria de Informacao Estatistica e VC e empirica e fundamentada em amostras independentes do arquivo original. O PLS superou os demais metodos de regressao, fornecendo predicoes satisfatorias quando utilizadas apenas informacoes genotipicas (painel de SNP de baixa densidade). Alem disso, os efeitos dos SNPs estimados via PLS possibilitaram identificar uma regiao relevante no cromossomo 4 que pode influenciar as caracteristicas estudadas. Os metodos GL e VC foram similares quanto a determinacao do numero otimo de componentes na analise PLS, porem o metodo GL pode ser recomendado devido a sua maior fundamentacao estatistica.