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Los humedales de montana de San Cristobal de Las Casas, Chiapas, Mexico, se localizan a mas de 2,000 m snm y su extension se ha reducido notablemente debido a urbanizacion, contaminacion, mineria y actividades agropecuarias. Se presenta una lista de los macrofitos registrados en 4 humedales. Los muestreos fueron sistematicos y ad libitum . Las especies se clasificaron en hidrofitas o terrestres y se incluye su estado de conservacion (UICN y NOM-059), nivel de endemicidad y si habian sido reportadas para Chiapas o si se amplia su distribucion. Se identificaron 55 familias de plantas vasculares con 151 especies, 63 de las cuales son hidrofitas. Treinta especies estan clasificadas como preocupacion menor, ninguna esta en la NOM-059. Cinco especies son endemicas de Mexico y 1 de Chiapas. Cinco son nuevos registros para Chiapas: Hydrocotyle ranunculoides, Egeria densa, Spergularia mexicana, Wolffia columbiana y Muhlenbergia subaristata . Cuatro especies acuaticas son exoticas: Eichhornia crassipes, Hydrocotyle verticillata, H. ranunculoides y E. densa , asociadas a aguas contaminadas. Se amplia la distribucion altitudinal de Cyperus articulatus y Phragmites karka . No se detectaron 56 monocotiledoneas acuaticas registradas historicamente para Chiapas por arriba de los 2,000 m snm, lo que podria indicar que posiblemente se enfrenta un proceso de extincion local.